Por medio del fomento de procesos de investigación y acción política, del apoyo a procesos comunitarios en defensa de los territorios colectivos, del fortalecimiento de gobiernos propios y del desarrollo de una economía autogestionaria, el Colectivo de Trabajo Jenzera busca fortalecer las capacidades propias de las organizaciones de los pueblos indígenas, afrocolombianos y campesinos para decidir autónomamente sobre su vida social, política y económica. Jenzera aspira que por medio de las herramientas teóricas y prácticas que ofrece, las comunidades construyan alternativas de vida solidarias con todas las expresiones de vida biológica y cultural. En tal sentido una señal característica de Jenzera es que agencia políticas de respeto a los derechos humanos, la equidad de género y el desarrollo de relaciones interculturales, para fortalecer espacios de convivencia interétnica, que por naturaleza son una apuesta en favor de la vida y una resistencia a la violencia.